Você pode ter acesso ao SISCOMEX dentro de sua própria empresa, interligando-se ao sistema. Para isso, antes da primeira operação é necessário dirigir-se a uma unidade da Receita Federal do Brasil, a fim de obter uma senha. Esta senha é vinculada ao seu próprio CPF.
O acesso ao SISCOMEX pode ser efetuado a partir de qualquer ponto conectado (bancos, corretoras, despachantes aduaneiros ou o próprio estabelecimento do usuário), bem como por meio de terminais instalados nos órgãos federais encarregados do controle do comércio exterior.
O Sistema está concebido de forma a caracterizar uma operação de exportação por meio de um registro (Registro de Exportação – RE), prevendo, em determinados casos, outro módulo: Registro de Operação de Crédito - RC.